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SHERLOCK:CRISPR赋能的核酸检测革命

发表时间:2025-12-25

在临床诊断、病原体筛查等领域,核酸检测的快速性、灵敏性与便携性始终是核心诉求。传统检测方法如PCR虽有效,但依赖专业仪器,难以满足现场应用需求。而基于CRISPR-Cas系统的SHERLOCK技术,通过创新性结合核酸预扩增与Cas酶的特异性识别,打造出兼具高灵敏度、强特异性与便携性的核酸检测平台,为核酸检测领域带来了突破性变革。

SHERLOCK全称为特异性高灵敏度酶促报告基因解锁技术,其核心原理源于Cas13和Cas12酶的"附带活性"——这些酶在通过可编程crRNA识别特定目标核酸后,会激活非特异性核酸内切酶活性,切割旁侧的报告分子产生可检测信号。该技术通过四步核心流程实现核酸检测:首先制备LwaCas13a蛋白与crRNA等关键试剂,随后提取样本中的目标核酸,通过重组酶聚合酶扩增(RPA)技术对目标进行等温预扩增并引入T7启动子(Cas12检测无需此步骤),最后利用Cas酶的附带活性切割报告分子,通过荧光或侧向流动等方式读取结果。整个流程设置时间不足15分钟,总检测时长可控制在1小时内,高效适配快速检测需求。


图 1 | SHERLOCK 实验完整工作流程

相较于传统检测技术,SHERLOCK展现出三大核心优势。在检测性能上,它能实现单分子级检测(2 aM浓度),可区分目标序列中的单核苷酸错配,轻松辨别登革热病毒与寨卡病毒等相似病原体,甚至能在背景丰度仅0.1%的样本中检测到癌症相关突变。在实用性上,该技术兼容DNA与RNA双目标检测,支持荧光检测、侧向流动可视化检测等多种读数方式,其中侧向流动检测无需专业仪器,仅需几分钟即可通过肉眼观察结果,完美适配资源有限的现场场景。在成本控制上,单重反应成本仅约0.60美元,crRNA合成成本低,酶组件可大规模生产,具备广泛推广的经济基础。

根据实验设计的不同,SHERLOCK分为两步法与一步法两种形式。两步法将预扩增与Cas检测分离进行,优化难度低、灵敏度更高(可达zeptomolar级别),适合样本成分复杂的场景;一步法则将所有反应整合在单个体系中,检测时长缩短至15-30分钟,污染风险更低,更适合高通量、定量检测需求。此外,通过空间多重或光谱多重设计,该技术可在单个反应中同时检测多达四个目标,进一步拓展了应用场景。

在实际应用中,SHERLOCK已展现出强大的适配能力。它成功应用于寨卡病毒、登革热病毒等病原体的现场检测,可直接从患者尿液、血清样本中快速筛查,还能区分不同地域来源的病毒菌株;在基因分型与癌症检测领域,其单核苷酸特异性可精准识别循环游离DNA中的癌症相关突变;在农业与环境监测中,也能高效检测病原菌与抗性基因。

尽管优势显著,SHERLOCK仍存在一定局限性,如需专业知识制备反应组件、缺乏商业化预设计方案、难以实现绝对数字定量等,使其在部分常规实验室应用中暂无法完全替代PCR技术。但随着技术的持续优化,这些问题正逐步得到解决。未来,随着试剂制备的标准化、检测流程的简化以及多重检测能力的提升,SHERLOCK有望在临床床旁检测、突发疫情防控、基层医疗筛查等领域发挥更大作用,推动核酸检测技术迈入便携化、精准化、低成本的全新阶段。

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